Gromacs分子动力学
课程1 基础理论——分子模拟基础理论
课程2 GROMACS 程序 入门 学会编译方法,安装自己的GROMACS可执行程序,并运行一个例子。
课程3 生物体系 建模掌握 不同体系快速搭建方法 ,使学员具有扎实的 建模 基础
课程4 模拟结果分析掌握不同生物体系所 需 分析方法,生成拓扑结构和坐标文件
课程5 水溶性蛋白质分子动力学模拟
课程6 分子动力学结果分析
课程7 蛋白质结合自由能计算(伞形采样法为例)
课程8 生物膜磷脂双分子层生物膜、膜蛋白等建模
课程9 Martini粗粒化力场--可溶性蛋白模拟
课程10 药物分子开发溶剂筛选
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